国家税务总局税收科学研究所系国家税务总局直属事业单位，成立于1998年10月。现任所长曾国祥、副所长刘佐。
    税收科学研究所定编42人，现在具有高级专业技术职务的研究人员占61%，具有中级专业技术职务的研究人员占21%，具有博士、硕士学位的研究人员占29%，初步形成一支以中高级专业人员为主，中青年为骨干，具有较高知识结构的专业税收研究队伍。
    税收科学研究所是国家税务总局税收科研的资料库、信息库、理论库、参谋部和组织动员部。本所坚持“四个面向”和“三个服务”的工作方针，即面向实际、面向地方，面向基层，面向企业；坚持为税制改革服务，为税收中心工作服务，为领导决策服务。主要承担国家税务总局和各有关部门下达的重点课题的研究任务，为国家宏观经济决策提供税收方面的科学依据和参考意见。

税收科学研究所的主要职能是：
(一)根据社会主义市场经济的客观要求，制定理论研究规划，进行税收理论和优化税制的目标、框架的研究。
(二)根据国家宏观经济政策和社会经济结构的变化，开展中长期税收政策研究。
(三)研究国外税制和税收理论，及时反映国外税收动态，开展税收研究的国际交流与合作。
(四)中国税史研究与史料的收集管理。
(五)收集、整理、翻译并及时提供税收信息资料，逐步建立全国税收科研资料中心。
(六)管理本局图书馆和阅览室。
(七)组织、指导、协调全国税务系统的科研工作。
(八)参加有关部门课题研究。
(九)参与中国税务学会、中国税务咨询协会、中国国际税收研究会开展的学术交流活动。
(十)完成总局领导交办的其他任务。

税收科学研究所的机构设置是：
(一)办公室：协助所长处理所内日常工作，负责制定本所工作计划和制度，起草工作总结；负责文件的运转；负责人事、财务及后勤事务的管理；参与全国税收科研工作会议等会议的组织工作；参与课题研究。

(二)科研组织处：负责制定本所年度税收科研动态和科研成果。负责税收理论研讨会和培训班的组织工作及专家委员会和特约研究员的联系工作。具体组织对科研成果的评审、鉴定、奖励工作。参与课题研究。

(三)理论政策研究室：负责制定税收理论研究计划，负责税收基础理论研究和税史研究。每年对税收理论研究和税收形势、特点进行述评。参加税收骨干培训教材的组织、编写与授课。负责与有关理论研究机构的联系。

(四)国外税收研究室：负责制定国外税收研究计划，进行国外税收的理论研究，比较分析各国税制特点及发展情况，撰写研究报告。翻译国外有关税收论著，及时介绍、吸收国外最新研究成果。负责与国际税收研究会、海外有关税收机构各税务专家的联系，建立经常性的合作关系。负责与本所有关的外事工作。

(五)图书资料室：负责收集、整理、翻译、编译国内外有关税收资料，提供国内外最新动态信息。负责与有关科研院所、资料中心、信息中心进行联系和资料交换。编辑期刊（月）《税收研究资料》、《税收与经济文摘》。负责中外文税收专业书籍、期刊、报纸的定购和管理。负责税收史料的征集、管理和查阅、参与课题研究。

    
    税收科学研究所不定期的向国家税务总局领导及有关部门和全国税务系统科研部门提供《税收科研简报》、《研究报告》等内部刊物。《税收科研简报》主要以短、平、快的方式及时反映全国税收科研工作的动态、信息及国内外最新税收资料。《研究报告》主要刊登在课题研究的基础上形成的有观点、有分析、有建议的研究成果。
  《税收研究资料》是由本所主编的税收理论研究资料性内部刊物。全年出版12期，约100万字。该刊面向税收科研部门、大专院校、税务人员、和税收理论工作者，主要刊登国内外税收科学研究的新成果和学术动态，关于经济改革、税制改革中的热点、难点问题的研究成果，税制改革和税收政策的调研报告，税务系统出国团组考察报告、国家税务总局领导的有关讲话等。
  《税收与经济文摘》是本所主办的月度信息性资料，它根据经济、税收现状和发展趋势及其反映的重点、热点、难点问题，从全国重点经济类刊物登载的文章中，选择重要信息，加以汇集而成，每期约4万字，全年50万字。